به گزارش سایت رسمی فدراسیون فوتبال، قرعه کشی مرحله سوم مسابقات لیگ قهرمانی نوجوانان باشگاه های کشور به صورت وبینار و با حضور رضا عبدی مدیر مسابقات فوتبال پایه برگزار شد و براین اساس مسابقات در این مرحله به صورت حذفی رفت و برگشت برگزار می شود که در نهایت برنده دیدارها به مرحله پایانی راه پیدا می کنند.مسابقات مرحله پایانی به صورت متمرکز برگزار می شود.

تاریخ مسابقات دور رفت:
جمعه ۲۴ فروردین ۱۴۰۳ 
رهروان فوتبال تبریز- سپاهان اصفهان
پارس برازجان – شاهین آمل
نوین فولاد یزد – فولاد خوزستان

تاریخ مسابقات دور برگشت:
جمعه ۳۰ فروردین ۱۴۰۳
فولاد خوزستان – نوین فولاد یزد
سپاهان اصفهان – رهروان فوتبال تبریز
شاهین آمل – پارس برازجان